Enquête canadienne sur les eaux usées (ECEU)

Information détaillée pour janvier 2024 au mars 2026

Détecter et mesurer les tendances de la charge virale des maladies infectieuses, y compris le SRAS-CoV-2, la grippe A et B et le virus respiratoire syncytial (VRS) par la surveillance épidémiologique des eaux usées.

Mesurer, sur une base bimensuelle, les charges et la consommation de diverses substances contrôlées à partir de l'analyse des eaux usées municipales.

Date de la parution - 22 septembre 2026

• Aperçu
• Sources de données et méthodologie
• Exactitude des données

Aperçu

L'enquête canadienne sur les eaux usées (ECEU) a été lancée en mars 2019. L'épidémiologie basée sur les eaux usées applique des techniques analytiques aux eaux usées afin d'estimer la consommation de substances contrôlées, et les niveaux de maladies infectieuses et de résistance aux antimicrobiens au niveau communautaire. Elle permet de générer des données en temps quasi réel sur les tendances géographiques et temporelles sans qu'il soit nécessaire de procéder à des enquêtes autodéclarées, afin de servir de système d'alerte précoce et de surveiller l'efficacité des mesures de santé publique.

L'ECEU comporte actuellement deux volets :

- La surveillance et l'estimation des niveaux de diverses substances contrôlées dans les eaux usées.

- La détection et la surveillance des niveaux de maladies infectieuses dans les eaux usées en collaboration avec l'Agence de la santé publique du Canada (ASPC).

Période de référence : quotidien

Période de collecte : Variable - actuellement la collecte débute le deuxième mercredi de chaque mois impair pour sept jours consécutifs pour le volet des substances contrôlées, et deux fois par semaine pour le volet des maladies infectieuses.

Sujets

• Mode de vie et conditions sociales
• Santé

Sources de données et méthodologie

Population cible

Usines de traitement des eaux usées dans les municipalités et les régions du Canada.

- Substances contrôlées : région métropolitaine de Vancouver, Edmonton, Prince Albert, Saskatoon, Toronto, Montréal, Moncton et Halifax.
- Maladies infectieuses : région métropolitaine de Vancouver, Calgary, Edmonton, London, Toronto, région de Peel, Kingston, Montréal, Moncton et Halifax.

Élaboration de l'instrument

Un questionnaire électronique unique, composé de variables compilées par le personnel concerné des usines de traitement des eaux usées en fonction de la conception de la station d'épuration et de la zone couverte.

Le questionnaire Excel est un questionnaire mensuel ou hebdomadaire, composé de variables compilées par les ingénieurs des usines de traitement des eaux usées, telles que les données sur le débit de l'eau, les résultats des tests de qualité de l'eau et les conditions météorologiques ou d'autres événements qui pourraient avoir un impact sur les résultats.

Les questionnaires ont été élaborés en consultation avec des experts en la matière, des répondants potentiels, des utilisateurs de données et des spécialistes de la conception de questionnaires. Ils sont soumis par courrier électronique ou par un service de transfert électronique de fichiers (STEF).

Échantillonnage

Il s'agit d'un recensement avec plan longitudinal.

Unité d'échantillonnage:
Usines de traitement des eaux usées.

Sources des données

Il s'agit d'une enquête à participation volontaire.

Les données sont obtenues directement auprès des répondants.

Pour le volet des substances contrôlées, le personnel des usines de traitement des eaux usées (UTEU) prélève des échantillons composites d'eaux usées sur 24 heures et enregistre les débits quotidiens des influents pendant une période d'une semaine au cours du mois de référence. Les échantillons sont livrés au Centre de toxicologie du Québec (CTQ) à des fins d'analyse à la fin de la période de collecte. Les métadonnées propres aux UTEU, y compris l'information sur les paramètres de qualité des eaux usées au moment de l'échantillonnage, sont envoyées à Statistique Canada par les UTEU. Les résultats de l'analyse en laboratoire par le CTQ sont envoyés à Statistique Canada une fois l'analyse des échantillons terminée.

Pour le volet de maladies infectieuses, le personnel des stations d'épuration des eaux usées prélève deux fois par semaine des échantillons composites d'eaux usées de 24 heures pendant la période de collecte. Les échantillons sont livrés au Laboratoire national de microbiologie (LNM) pour analyse. Les résultats de l'analyse de laboratoire effectuée par le LNM sont envoyés à Statistique Canada. Les métadonnées propres aux UTEU, y compris l'information sur les paramètres de qualité des eaux usées au moment de l'échantillonnage, sont envoyées à Statistique Canada par les UTEU.

Détection des erreurs

Pour le volet des substances contrôlées, la procédure d'analyse chimique a été validée pour sa précision et sa cohérence. Les résultats des échantillons d'eaux usées sont comparés aux résultats des échantillons historiques afin d'identifier et d'éliminer les valeurs aberrantes extrêmes.

Pour le SRAS-CoV-2, jusqu'en avril 2022, les échantillons d'eaux usées sont analysés en double technique contre deux cibles chacun (N1/N2) pour valider la mesure du SRAS-CoV-2. Depuis la détection d'Omicron dans les eaux usées en décembre 2021, le test N1 a commencé à présenter une sensibilité diminuée par rapport au N2. Par conséquent, le test N200 a été utilisé à la place pour effectuer la surveillance des eaux usées avec le N2, car ces deux tests corrélaient bien entre eux. Avec le temps, le test N200 a également commencé à présenter une sensibilité diminuée par rapport au N2. Pour cette raison, l'utilisation du test N200 a été arrêtée en décembre 2024 et seul le test N2 est désormais utilisé pour la surveillance du SRAS-CoV-2.

Imputation

Aux fins de l'estimation de la charge virale et les charges de drogues, les mesures de concentration inférieures à la limite de détection sont imputées avec une valeur inférieure à la limite.

Estimation

L'analyse chimique des concentrations de métabolites des drogues ciblées dans les eaux usées de même que les débits enregistrés au moment de l'échantillonnage à l'usine de traitement des eaux usées mènent au calcul de la charge des drogues (en unités de milligrammes de métabolite / mille personnes / jour). La charge est divisée par une estimation de la taille de la population contribuant aux eaux usées pour normaliser les résultats de municipalités de différentes tailles.

Le volet des substances contrôlées présente la moyenne, la valeur minimale et la valeur maximale des estimations quotidiennes de consommation par habitant (jusqu'à 7 par mois) pour chaque ville et chaque mois de collecte pour lesquels des données sont disponibles. Lorsqu'une ville compte un seul site de traitement des eaux usées, la moyenne est calculée comme la moyenne non pondérée des valeurs quotidiennes (jusqu'à 7). Lorsqu'une ville compte plusieurs sites, les valeurs quotidiennes sont d'abord calculées sous forme de moyennes pondérées selon la population de l'ensemble des sites de la ville pour chaque jour, afin d'obtenir jusqu'à 7 valeurs quotidiennes.
Les valeurs de consommation minimales, maximales et moyennes diffusées sont ensuite déterminées à partir de ces valeurs quotidiennes.

La concentration de particules virales du SRAS-CoV-2 dans l'influent primaire des eaux usées est mesurée en double par RT-qPCR. En outre, les concentrations du virus de l'hépatite murine (VHM) et du virus de la panachure légère du poivre (VPLP) sont également mesurées par les mêmes moyens à des fins d'assurance qualité. Des métadonnées englobant les indicateurs épidémiologiques et les métadonnées des stations d'épuration sont publiées pour faciliter l'interprétation des données.

Évaluation de la qualité

Les données sont vérifiées pour leur caractère raisonnable et leur cohérence.

Certains des échantillons prévus n'ont pas pu être analysés en raison de problèmes survenus dans les usines de traitements des eaux usées ou liés à l'expédition et à la manipulation des échantillons (par exemple, les échantillons arrivent décongelés ou cassés).

Pour le volet des substances contrôlées, certains échantillons ont été considérés comme des valeurs extrêmes aberrantes et ont donc été traités comme des échantillons manquants. Les échantillons manquants ont été exclus du calcul des moyennes mensuelles.

Une plage de valeurs quotidiennes moyennes est disponible pour les estimations de la charge par habitant. Les données sont supprimées pour les mois pour lesquels les données provenant de tous les sites de la ville contribuant à la collecte ne sont pas complètes pour au moins 5 des 7 jours. Lorsqu'une ville compte un seul site de traitement des eaux usées, les valeurs minimale, maximale et moyenne pour le mois ne sont diffusées que si des données sont disponibles pour au moins 5 jours de la semaine de référence. Lorsqu'une ville compte plusieurs sites de traitement des eaux usées contribuant à la collecte, les valeurs minimales, maximales et moyennes ne sont diffusées que si, pour au moins 5 jours de la semaine de collecte, tous les sites de la ville ont déclaré des données.

Pour le volet de maladies infectieuses, lorsque l'on soupçonne un manque de fiabilité, les résultats ne sont pas communiqués.

Contrôle de la divulgation

La loi interdit à Statistique Canada de divulguer toute information recueillie qui pourrait dévoiler l'identité d'une personne, d'une entreprise ou d'un organisme sans leur permission ou sans en être autorisé par la Loi sur la statistique. Diverses règles de confidentialité s'appliquent à toutes les données diffusées ou publiées afin d'empêcher la publication ou la divulgation de toute information jugée confidentielle. Au besoin, des données sont supprimées pour empêcher la divulgation directe ou par recoupement de données reconnaissables.

Révisions et désaisonnalisation

Les données peuvent faire l'objet d'une révision si des erreurs de calcul sont détectées, si des analyses de laboratoire sont répétées ou si des connaissances scientifiques supplémentaires sur les données justificatives deviennent disponibles. Pour l'instant, aucun calendrier de révision n'a été établi.

Exactitude des données

Les estimations de la consommation de drogues à partir des eaux usées sont sujettes à des incertitudes qui surviennent à plusieurs étapes du processus d'estimation. Ces étapes comprennent la collecte des échantillons d'eaux usées, la mesure des biomarqueurs de drogues, la stabilité des biomarqueurs dans les eaux usées, le calcul de la consommation de drogues à partir des mesures des biomarqueurs et des profils d'excrétion, ainsi que les estimations de la population représentée par chaque station de traitement des eaux usées. Castiglioni et coll. (2013) décrivent ces sources d'incertitude et fournissent des estimations de leurs contributions relatives à l'incertitude globale entourant les estimations effectuées à partir des eaux usées.

Il n'est pas possible pour Statistique Canada de mener des analyses similaires pour évaluer la contribution relative de chaque source d'incertitude. En particulier, l'incertitude associée à la mesure des biomarqueurs ne peut pas être estimée à partir des données disponibles puisqu'un seul échantillon a été analysé par jour à chaque site. Par conséquent, les estimations doivent être interprétées comme des approximations de la consommation de drogues et non comme des mesures exactes.

La concentration de SRAS-CoV-2 dans les eaux usées est déterminée au LNM sur la base de méthodologies précédemment développées pour des virus dont la structure est similaire à celle du SRAS-CoV-2. L'ARN est extrait des solides des eaux usées sur une plateforme automatisée d'acide nucléique, puis quantifié par la réaction en chaîne de la polymérase à transcription inverse (RT-qPCR).

La limite de détection (LOD) a été estimée par le LNM à 2,02 copies de génome par millilitre d'influent d'eau usée brute. La performance de la méthode a été comparée à celle d'études évaluées par des pairs et à celle d'études préimprimées employant des méthodes similaires dirigées contre les mêmes cibles moléculaires du SRAS-CoV-2 dans des études longitudinales d'échantillons d'eaux usées du monde réel. La gamme de concentrations virales rapportées dans les études précédentes était plus grande que la limite de détection déterminée par le LNM pour la majorité des échantillons, ce qui suggère que le test employé ici serait sensible à la même gamme de matières d'entrée virales, et donne confiance dans la performance du test d'eaux usées du LNM.

Le LNM a également participé à de nombreuses séries d'une étude interlaboratoires menée par l'Agence ontarienne des eaux propres avec d'autres laboratoires au Canada qui ont effectué des analyses similaires du SARS-CoV-2 dans les eaux usées. D'après les résultats de cette étude, la méthode du LNM présente une sensibilité et une spécificité supérieures à la moyenne.